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學術沙龍預告:從高維癌癥基因組數據中學習

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  • 投稿時間:2019-06-18
  • 投稿人:人才與國際合作交流辦公室

本次學術沙龍”教師發展中心邀請中國科學院昆明植物研究所寸玉鵬教授,與我校師生分享從高維癌癥基因組數據中學習C868彩票。具體安排如下C868彩票,歡迎感興趣的師生參加:

一、 主題:從高維癌癥基因組數據中學習

二、 時間2019年06月20號(周四)16:00

三、 地點創新中心A102會議室

四、 主講人:寸玉鵬 研究員

五、 主持人:生命科學與技術學院 劉建魁 教授

六、 內容簡介

    現代基因組學技術的發展大大地促進了生物醫學的研究和觀念,個體化醫療就是在基因組學的影響下發展起來的一種精準醫學C868彩票,從大量特定疾病患者群的分子生物學數據中,發現疾病相關的基因和通路C868彩票,從而將病因精確到分子水平,并據此對患者制定個體化的治療方案。新一代高通量測序大大降低了測序的成本,同時極大提高了測序效率。但是卻給下游的海量生物數據處理帶來巨大的挑戰C868彩票。我將介紹如何機器學習模型和統計建模對海量生物醫學數據進行系統地處理、整合、建模、及發掘C868彩票,從而整合多組學數據用于癌癥預后相關基因的發現,和推斷癌癥發生演化的過程,從而加速個性化醫療C868彩票、基因組醫學C868彩票、及大數據預測科學在精準醫學中的應用C868彩票。 

七、 主講人簡介

寸玉鵬,現任中國科學院昆明植物研究所研究員, 2014年在波恩大學的計算生命科學專業取得的博士學位;2013年9月進入德國科隆大學轉化基因組學系,在Martin Peifer教授和Roman Thomas教授的指導下進行計算癌癥基因組學和生物信息學的博士后研究;2018年7月,通過中國科學院"百人計劃"技術英才的支持進入中科院昆明植物所組建"iFlora生物信息中心",從事機器學習和計算基因組學的研究, 主要代表性論文有:

1、Yupeng Cun*, Tsun-Po Yang*, Viktor Achter*, Ulrich Lang, Martin Peifer (2018) Copy number analysis and inference of subclonal populations in cancer genomes using Sclust. Nature Protocols 13,1488–1501

2C868彩票、Julie George*, Jing Shan Lim*, Se Jin Jang, Yupeng Cun(4th/96), …, Martin Peifer, Julien Sage & Roman K. Thomas (2015) Comprehensive genomic profiles of small cell lung cancer. Nature 524(7563)

3、Yupeng Cun, Holger Fr?hlich(2014) netClass: an R-package for network based, integrative biomarker signature discovery. Bioinformatics 30(9)

4、Yupeng Cun, Holger Fr?hlich(2013) Network and data integration for biomarker signature discovery via network smoothed T-statistics. PLoS ONE 8(9):e73074

5、Yupeng Cun, Holger Fr?hlich (2012)  Prognostic gene signatures for patient stratification in breast cancer: accuracy, stability and interpretability of gene selection approaches using prior knowledge on protein-protein interactions. BMC Bioinformatics 13(69).

八、 主辦單位:人力資源部教師發展中心

        承辦單位:生命科學與技術學院

人力資源部教師發展中心

                                   2019618


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